Coronavirus mutations: is it true that strains of SARS-CoV-2 are becoming more dangerous - ForumDaily
The article has been automatically translated into English by Google Translate from Russian and has not been edited.
Переклад цього матеріалу українською мовою з російської було автоматично здійснено сервісом Google Translate, без подальшого редагування тексту.
Bu məqalə Google Translate servisi vasitəsi ilə avtomatik olaraq rus dilindən azərbaycan dilinə tərcümə olunmuşdur. Bundan sonra mətn redaktə edilməmişdir.

Coronavirus mutations: is it true that strains of SARS-CoV-2 are becoming more dangerous

As the COVID-19 pandemic develops, the SARS-CoV-2 coronavirus that causes this disease continues to mutate, that is, change. This means that its properties also change, and new strains may well pose a great threat, for example: it is easier to transmit from person to person or cause a more serious disease, writes Air force.

Photo: Shutterstock

Cases of re-infection have already been described, when a recovered person fell ill again having met with another version of the same infection. Moreover, it is known that the disease in this case can proceed even in a more severe form.

What strains of the virus are known to scientists at the moment and how dangerous are they? And could a potential vaccine protect against all known variations of the coronavirus?

What is a strain

Каждый вирус имеет свой геном — уникальную специфическую последовательность ДНК или РНК.

Геном SARS-CoV-2 — это длинная последовательность РНК, состоящая примерно из почти 30 тысяч знаков (нуклеотидов), идущих друг за другом в строгом порядке. Этот порядок способен меняться: при сборке каждой новой копии вируса в любом из этих звеньев может произойти ошибка — замена одного нуклеотида другим, и в результате немного изменится код всей цепочки.

В каждом новом «хозяине» геном вируса немного изменяется. Эти изменения могут быть совсем незначительными, но они позволяют установить связь между инфицированными или проследить путь, который проделал вирус.

Используя слово «штамм», ученые имеют в виду генетически отличную ветвь вируса, отличающуюся одной или несколькими мутациями от своего «родителя». Разница может составлять лишь долю процента от всего генома, но каждая новая последовательность РНК может положить начало новой ветви вируса, то есть новому штамму.

Скорость, с которой происходят генетические изменения, у разных вирусов различна — и SARS-CoV-2 мутирует относительно медленно. Большинство геномов этого вируса отличаются друг от друга нзначительным количеством точечных замен, а число отличий от исходного варианта не превышает 30 на почти 30 тысяч нуклеотидов.

What strains of coronavirus exist

Основных штаммов нового коронавируса семь, они обозначаются буквами GR, G, GH, O, S, L и V. Все началось со штамма L — именно его обнаружили в китайском Ухане в декабре 2019 года. Однако теперь он постепенно исчезает.

The rest of the strains are distributed unevenly around the world: on each continent, the most common, as a rule, no more than two main variations. Their spread can be observed on the Nextstrain interactive map compiled by scientists, which tracks virus mutations.

Российский научный центр «Вектор» в октябре сообщил, что выявил более 80 мутаций коронавируса на территории страны. Но широко распространены в основном два штамма — европейский и азиатский, сообщили в Роспотребнадзоре. При этом последний завезен не из Китая, а из других азиатских стран.

These two strains are found in 99% of the studied samples in Russia, the department said.

On the subject: 'It remained unnoticed for decades': scientists have found out how SARS-CoV-2 originated and why it infects people

How the virus mutated in Russia

«Общее число мутаций, которые в совокупности выявлены в секвенированных геномах вируса SARS-CoV-2, составляет многие тысячи, однако только единичные из них зафиксировались и стабильно наследуются», — поясняют в Роспотребнадзоре. Сейчас насчитывается около 22 таких единичных мутаций, они произошли в январе-марте этого года. Позднее новые штаммы уже широко не распространялись, считают в ведомстве.

В начале эпидемии в России в геноме вируса стабильно зафиксировались три основные группы мутаций, которые сформировали, по данным исследования Роспотребнадзора, «три ветви эволюционного развития». К концу марта 2020 года развитие этих трех направлений замедляется — и основными циркулирующими в стране стали штаммы с мутацией в гене ORF1b (P314L) и S (D614G).

These two mutations were the most significant permanent change in the genome of the SARS-CoV-2 virus, the study highlights. In Rospotrebnadzor, it is believed that a mutation in the S gene is associated with a decrease in pathogenicity (the ability to cause disease by penetrating into the body). The department notes that this can be explained by the improvement in the treatment of patients during the pandemic.

The effect of a mutation in the ORF1b gene (P314L) is still poorly understood.

«Вирусы мутируют постоянно, однако коронавирусы мутируют значительно медленнее по сравнению с другими РНК-вирусами», — поясняет Любовь Козловская, заведующая лабораторией полиомиелита и других энтеровирусных инфекций федерального научного центра исследований и разработки иммунобиологических препаратов им. М.П. Чумакова.

«Несмотря на активную циркуляцию по всему миру, SARS-CoV-2 изменился менее чем на 0,1% по сравнению с вирусом, изначально выделенным в Китае 11 месяцев назад. Основные изменения выявлены в первые месяцы распространения, и варианты вируса, широко циркулирующие в настоящее время, сходны с теми, которые выделяли весной», — говорит она.

Strain S (D614G) is now the object of close attention of scientists. It was first identified in August in Indonesia; then it was reported that this strain was allegedly 10 times more infectious than the original strain of the virus.

Некоторые исследования, которые пока находятся на стадии препринта (то есть не отрецензированы и не опубликованы в научных изданиях), приходят к выводу, что у этой мутации действительно может быть более высокая инфицирующая способность, а вирусная нагрузка при инфицировании этим штаммом — более высокой. Но окончательных выводов по этому поводу нет.

«Вирус довольно быстро приобрёл замену в поверхностном белке вириона S (спайк), которая увеличивает его контагиозность (свойство инфекционных болезней передаваться от больных организмов — здоровым. — BBC), но не утяжеляет течение заболевания», — комменттирует Козловская. По ее словам, остальные отличия в штаммах вируса минимальны.

Первые варианты вируса с распространенными в России двумя мутациями выявлены в конце января в Китае, затем — в Австралии. В феврале эти варианты обнаружили в большинстве стран Западной Европы, в Саудовской Аравии, США, Канаде, Мексике, Бразилии, Марокко и Сенегале.

A detailed comparison of the genomes of the virus in Russia and foreign countries suggests that strains imported from Western Europe in March and April 2020 are circulating in the country, Rospotrebnadzor notes.

«[Коронавирус] в течение этих девяти месяцев мутировал очень мало и не изменялся в тех его локусах, которые отвечают за проявления эпидпроцесса, за его, так скажем, агрессивность и злость», — заявила на прошлой неделе глава Роспотребнадзора Анна Попова. В ведомстве считают, что у вируса низкая способность к мутациям — он накапливает лишь около двух точечных замен в месяц, то есть за год может произойти около 24 мутаций.

«Распределение основных вариантов вируса, циркулирующих в России, в общем похоже на таковое в Европе. Некоторые отличия наблюдаются, но у нас нет оснований полагать, что эти отличия как-то изменяют клиническое течение или эпидемиологию COVID-19 в России по сравнению со странами Европы», — говорит Козловская из центра им. М.П. Чумакова.

В Роспотребнадзоре в ответ на запрос Би-би-си сообщили, что ежемесячно ученые ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» расшифровывают полностью более 150 геномов нового коронавируса. «Получаемые данные применяют для анализа актуальности используемых диагностических тест-систем, помогают выявлять завозные случаи, оценивать региональные особенности генетического разнообразия SARS-CoV-2», — заявили в ведомстве.

Now sequencing of the genomes of viruses is being carried out and the accumulation of data in various laboratories around the world, including in the Chumakov center, says Kozlovskaya. Scientists, she said, will correlate the genomes of viruses with the clinical picture of patients from whom they are isolated, which will make it possible to shed light on the significance of the most common mutations.

Studying the impact of each specific mutation on the clinical picture of COVID-19 disease is difficult, she admits. Scientists will study the significance of each specific mutation for the structure of mutant proteins, as well as determine the role of these mutations in the development of clinical symptoms and lung damage in animal experiments.

В «Векторе» не ответили на вопросы Би-би-си относительно процесса изучения штаммов коронавируса. Там, как и в ФНЦИРИП им. М.П. Чумакова, на данный момент разработали и анонсировали новые вакцины от SARS-CoV-2, которые ждут клинических исследований.

On the subject: Those who tested the Russian vaccine against COVID-19 revealed coronavirus

Should you be afraid of mutations

Основные вопросы, которые стоят перед учеными в связи с мутациями коронавируса, — это способность вакцины сформировать иммунную защиту, которая будет одинаково устойчива к разным штаммам. Важен также вопрос различий в воздействии на инфицированного. Например, могут ли одни штаммы быть заразнее других.

From the statements of Rospotrebnadzor it follows that the mutations of the virus are not so terrible. But in the scientific literature, several cases of re-infection with the coronavirus have already been reported.

Чтобы признать заражение повторным, ученые каждый раз проверяют генетический состав возбудителя и убеждаются, что штамм вируса отличается от того, что вызвал заболевание в первый раз — иначе нельзя с уверенностью утверждать, что это именно вторичная инфекция, а не затянувшийся первичный случай.

Dutch news agency BNO maintains a counter of all recurrent illnesses ever reported, each with a citation of the source. According to the agency, 24 cases of repeated infections are known in the world, one of them became fatal. An 89-year-old female patient from the Netherlands with cancer has died.

Re-infections have also occurred in Hong Kong, Belgium, the United States and Ecuador.

«Каждый день в России регистрируют почти 20 тысяч случаев заболевания, часть из них ассоциированы с вирусами, давно циркулирующими на территории страны, часть — с импортированными вариантами, ассоциированными с заражением вирусом на территории других стран, часто очень отдаленных, — поясняет Любовь Козловская. — Поэтому, конечно, возможен завоз и последующее выделение варианта вируса, который ранее не встречался в России, как это недавно произошло в Норвегии». Однако, по ее словам, это не означает моментальное изменение эпидемиологической ситуации с COVID-19.

In October, the Lancet published a study describing two cases of reinfection with coronavirus infection. One of the patients from Nevada, USA, after re-infection, the disease was more severe. The 25-year-old patient required hospitalization due to oxygen deficiency; computed tomography revealed that he had viral pneumonia.

Ученые выяснили, что он заразился другим штаммом, генетически отличным от прошлого возбудителя болезни. «Таким образом, прошлое воздействие SARS-CoV-2 может не гарантировать полного иммунитета», — делают вывод ученые. Они напоминают, что все люди, независимо от того, был ли у них ранее диагностирован коронавирус или нет, должны принимать одни и те же меры предосторожности.

Will vaccines be effective if the virus mutates?

Известно, что коронавирус мутирует медленнее, чем вирус гриппа: по разным оценкам, в два раза медленнее или на треть. В связи с этим вакцина от коронавируса «вероятно, будет стабильной и эффективной дольше, чем вакцина против гриппа», — предположил в беседе с HuffPost почетный доцент и клинический вирусолог университета Лестера Джулиан Танг.

При этом пока неизвестно, как долго будет сохраняться приобретенный с помощью вакцины иммунитет, даже если она будет работать как следует, напоминает ученый. Эффективность вакцины может зависеть и от индивидуальных особенностей организма — так же, как и у вакцины против гриппа, считает Танг.

So far, scientists are inclined to think that vaccines being developed around the world to combat the first strains of the new coronavirus will be just as effective against new mutations. A study by Australian and American scientists, which was carried out using computer simulations and experiments on ferrets, was published on October 8 in the scientific journal NPJ Vaccines. The animals were injected with a potential vaccine INO-4800 developed by the American company Inovio Pharmaceuticals.

Most of the vaccines being developed around the world were modeled after the original D-strain of the virus, which was more common among the sequences published at the start of the pandemic, the scientists explained.

Since then, the virus has mutated into the G strain, the variations of which are now dominant around the world. The researchers feared that this mutation would negatively affect the effectiveness of vaccines under development.

«Несмотря на мутацию D614G в шиповидном белке, мы подтвердили экспериментами и моделированием, что вакцины-кандидаты по-прежнему эффективны», — заявил один из авторов исследования, профессор Йоркского университета Сешадри Васан.

По словам ученого, обнаружилось, что наиболее часто встречающийся штамм G вряд ли потребует частого подбора новых вакцин — в отличие от гриппа, вакцину от циркулирующих штаммов которого разрабатывают каждый год.

Since the differences between the strains circulating in Russia are minimal, they most likely do not have a significant effect on the structure of viral proteins, Lyubov Kozlovskaya is convinced from the Center. M.P. Chumakov. This, she said, makes it possible to create and use a COVID-19 vaccine that does not have to be redone every year.

Do not forget that none of the vaccine developments in the world have yet passed the third phase of clinical trials, which conclude about its effectiveness.

В России эту стадию сейчас проходит вакцина центра имени Гамалеи «Спутник V». Две другие российские вакцины лишь готовятся к прохождению этой стадии.

Only after these studies, in which tens of thousands of people will take part, it will be possible to draw conclusions about the resistance of the immunity to coronavirus formed by vaccines.

Read also on ForumDaily:

Causes acute diarrhea: pig coronavirus, dangerous to humans, found in China

CDC statistics: from what people infected with coronavirus actually die

A vaccine that partially protects against COVID-19 already exists

Coronavirus can be re-infected: what you need to know

Educational program coronavirus Special Projects COVID-19
Subscribe to ForumDaily on Google News

Do you want more important and interesting news about life in the USA and immigration to America? — support us donate! Also subscribe to our page Facebook. Select the “Priority in display” option and read us first. Also, don't forget to subscribe to our РєР ° РЅР ° Р »РІ Telegram  and Instagram- there is a lot of interesting things there. And join thousands of readers ForumDaily New York — there you will find a lot of interesting and positive information about life in the metropolis. 



 
1086 requests in 1,175 seconds.